能仁寺，位于云山南路，占地10000平方米，现为山中唯一寺庙，始建于清咸丰、同治年间，建成后一度香火鼎盛，民国时戴季陶重修后还成为当时军政要人聚会之场所，后在抗战期间毁败。能仁寺的后山也因为抗法名将刘永福常来此游玩而闻名，如今寺内还有刘永福留下的虎字书刻。据记载，孙中山先生于1924年曾在此休憩，目前，能仁寺设有孙中山休憩纪念馆。

广州市政府于1993年投资修复能仁寺， 1995年5月对外开放。能仁寺地势三面环山，幽谷深藏，绿树成萌，寺里主要古迹有虎跑泉、甘露泉、玉虹池、流云飘月、古桥等。能仁寺是白云山恢复文物古迹中的典范，它以宏大的气势，众多的古迹吸引了许多前来参观与朝拜的游客。