至此，历经14年运行的老国债回购业务压缩完毕，同时，新国债质押式回购即“新回购”业务运行平稳，完全实现了取代老回购的目标。国债回购制度改革的成功，为发展交易所债券市场夯实了基础。
在国债回购改革启动前的2004年底，未到期国债回购余额（融资量）约1082亿元，参与机构上百家。
证监会认为，已开展的国债回购业务中尽管出现了一些违规行为，但大部分仍属于合规的正常业务。因此，如果在新旧制度转换时采取一刀切的方式简单处理，很可能导致部分问题资金链断裂从而严重影响市场稳定，形成新的市场风险。在摸清市场风险底数的情况下，证监会确定了先易后难、分步到位、配套实施、稳步推进的改革原则，在保证市场稳定的前提下分步推出新回购、逐步压缩老回购，通过一个新老并行阶段最终实现顺利转轨。
首先，先推新回购，维护市场正常的资金链。即在停止老国债回购之前，先开新的经完善后的国债回购，使正常的融资业务能继续运转，维护了正常的资金链和市场稳定。同时，实行“新老划断”逐步过渡的方式，新挂牌的质押式回购实行新规则，老回购继续实行原有规则，在新回购市场已取得一定发展的情况下，再加大对老回购市场份额的压缩力度。
其次，为减缓压缩老回购给市场造成的冲击，确保压缩措施不会引发市场风险，证监会以风险防范为核心制定了“先降温、后撤火”的压缩过渡方案，通过不断扩大新回购业务、明确市场预期的做法，引导市场参与者逐步减少老回购交易直至全部压缩完毕。
第三，区别情况，分类处理。针对老回购市场主体多、回购融资诱因差别大等情况，证监会对不同情况实行分类处理。其中重点加强了对高风险证券公司回购规模的压缩工作，要求公司结合重组工作压缩老回购，并在合法合规前提下协调其解决资金周转困难。
更为重要的是，经过一系列配套措施的组合运用，逐步建立起来的新国债回购制度在保障市场融资功能的同时，也具备了更为规范的运作程序：通过建立质押库以及按账户申报交易等制度切断券商挪券通道，从根源上防范挪用、串用风险；通过交易系统对回购交易申报进行前端检查，从技术上对挪用行为予以限制；通过推出投资者债券查询系统，在加强投资者保护的同时，形成对挪券行为强有力的外部监督和制约。新机制保障并促进了国债回购市场的健康快速发展，新回购业务推出以来交易平稳活跃。从2006年5月至2007年5月，新回购市场日均未到期融资额从18亿元增加到227亿元，日均融资额从4亿元增加到64亿元，完全实现了对老回购的替代。（夏丽华）
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